PIs Data Analysis
  2. PI Data Analysis
Species Distribution shows us the distribution of Pin-II PIs in various species. For this from tables PI_General_Features and Taxonomy, the relation between PI's and their Species can be retrived. From this relation we can calculate how many PI's belong to one particular specie.
Taxon Specie Solanaceae Count Of PIs
3476 Parasponia andersonii Non Solanaceae 1
3562 Spinacia oleracea Non Solanaceae 1
3694 Populus trichocarpa Non Solanaceae 1
3702 Arabidopsis thaliana Non Solanaceae 2
3711 Brassica campestris Non Solanaceae 1
3712 Brassica oleracea Non Solanaceae 1
3755 Prunus dulcis Non Solanaceae 3
3760 Prunus persica Non Solanaceae 3
3818 Arachis hypogaea Non Solanaceae 4
3827 Cicer arietinum Non Solanaceae 1
3871 Lupinus angustifolius Non Solanaceae 1
3880 Medicago truncatula Non Solanaceae 2
3983 Manihot esculenta Non Solanaceae 2
3988 Ricinus communis Non Solanaceae 1
4072 Capsicum annuum Solanaceae 99
4081 Solanum lycopersicum Solanaceae 21
4086 Nicotiana acuminata Solanaceae 1
4087 Nicotiana alata Solanaceae 2
4093 Nicotiana rustica Solanaceae 1
4096 Nicotiana sylvestris Solanaceae 10
4097 Nicotiana tabacum Solanaceae 22
4100 Nicotiana benthamiana Solanaceae 1
4108 Solanum chacoense Solanaceae 5
4111 Solanum melongena Solanaceae 1
4112 Solanum nigrum Solanaceae 4
4113 Solanum tuberosum Solanaceae 52
4146 Olea europaea Non Solanaceae 1
4155 Erythranthe guttata Non Solanaceae 1
4529 Oryza rufipogon Non Solanaceae 1
4533 Oryza brachyantha Non Solanaceae 1
4536 Oryza nivara Non Solanaceae 1
4537 Oryza punctata Non Solanaceae 1
4538 Oryza glaberrima Non Solanaceae 1
4540 Panicum miliaceum Non Solanaceae 3
4555 Setaria italica Non Solanaceae 2
4556 Setaria viridis Non Solanaceae 1
4558 Sorghum bicolor Non Solanaceae 3
4565 Triticum aestivum Non Solanaceae 3
4567 Triticum turgidum subsp. durum Non Solanaceae 1
4572 Triticum urartu Non Solanaceae 1
4577 Zea mays Non Solanaceae 2
4615 Ananas comosus Non Solanaceae 3
15368 Brachypodium distachyon Non Solanaceae 2
22663 Punica granatum Non Solanaceae 1
28930 Fagus sylvatica Non Solanaceae 1
29760 Vitis vinifera Non Solanaceae 3
33113 Atropa belladonna Solanaceae 1
33114 Capsicum baccatum Solanaceae 11
35889 Nicotiana glutinosa Solanaceae 2
37682 Aegilops tauschii Non Solanaceae 1
38414 Eragrostis curvula Non Solanaceae 3
39946 Oryza sativa subsp. indica Non Solanaceae 1
39947 Oryza sativa subsp. japonica Non Solanaceae 2
40148 Oryza glumipatula Non Solanaceae 1
40149 Oryza meridionalis Non Solanaceae 1
43335 Populus alba Non Solanaceae 1
49390 Coffea canephora Non Solanaceae 6
49451 Nicotiana attenuata Solanaceae 11
51240 Juglans regia Non Solanaceae 1
51351 Brassica rapa subsp. pekinensis Non Solanaceae 1
52838 Musa balbisiana Non Solanaceae 1
63057 Trema orientale Non Solanaceae 1
65489 Oryza barthii Non Solanaceae 1
69181 Brassica cretica Non Solanaceae 1
71139 Eucalyptus grandis Non Solanaceae 1
74649 Rosa chinensis Non Solanaceae 5
76336 Nicotiana repanda Solanaceae 1
77586 Leersia perrieri Non Solanaceae 2
79200 Daucus carota subsp. sativus Non Solanaceae 1
80379 Capsicum chinense Solanaceae 13
81866 Nicotiana clevelandii Solanaceae 1
81972 Arabidopsis lyrata subsp. lyrata Non Solanaceae 1
81985 Capsella rubella Non Solanaceae 1
88036 Selaginella moellendorffii Non Solanaceae 7
107243 Noccaea caerulescens Non Solanaceae 4
109376 Brassica oleracea var. oleracea Non Solanaceae 1
109975 Solanum americanum Solanaceae 4
112509 Hordeum vulgare subsp. vulgare Non Solanaceae 1
118690 Nicotiana cavicola Solanaceae 1
118701 Nicotiana linearis Solanaceae 1
118703 Nicotiana megalosiphon Solanaceae 1
118704 Nicotiana miersii Solanaceae 1
118709 Nicotiana simulans Solanaceae 1
118712 Nicotiana umbratica Solanaceae 1
131158 Saccharum hybrid cultivar R570 Non Solanaceae 2
132261 Cuscuta campestris Non Solanaceae 4
157652 Mucuna pruriens Non Solanaceae 1
172790 Solanum phureja Solanaceae 1
180498 Jatropha curcas Non Solanaceae 1
180675 Salvia splendens Non Solanaceae 1
192259 Genlisea aurea Non Solanaceae 2
200300 Nicotiana spegazzinii Solanaceae 1
200301 Nicotiana corymbosa Solanaceae 1
200306 Nicotiana occidentalis subsp. hesperis Solanaceae 1
200315 Nicotiana pauciflora Solanaceae 1
200316 Nicotiana obtusifolia Solanaceae 2
200361 Aegilops tauschii subsp. strangulata Non Solanaceae 2
206008 Panicum hallii Non Solanaceae 1
267555 Cuscuta australis Non Solanaceae 4
278839 Nicotiana quadrivalvis Solanaceae 1
429701 Handroanthus impetiginosus Non Solanaceae 3
472368 Dorcoceras hygrometricum Non Solanaceae 1
542762 Camellia sinensis var. sinensis Non Solanaceae 1
888268 Dichanthelium oligosanthes Non Solanaceae 4
906689 Dendrobium catenatum Non Solanaceae 1
981085 Morus notabilis Non Solanaceae 1
1088818 Apostasia shenzhenica Non Solanaceae 1
1504633 Panicum hallii var. hallii Non Solanaceae 4
2094558 Prunus yedoensis var. nudiflora Non Solanaceae 1
Genus Distribution shows us the distribution of Pin-II PIs in various Genus. For this from tables PI_General_Features and Taxonomy, the relation between PI's and their Genus can be retrieved. From this relation we can calculate how many PI's belong to one particular Genus.
Genus Solanaceae Count Of PIs
Aegilops Non Solanaceae 3
Ananas Non Solanaceae 3
Apostasia Non Solanaceae 1
Arabidopsis Non Solanaceae 3
Arachis Non Solanaceae 4
Brachypodium Non Solanaceae 2
Brassica Non Solanaceae 5
Camellia Non Solanaceae 1
Capsella Non Solanaceae 1
Cicer Non Solanaceae 1
Coffea Non Solanaceae 6
Cuscuta Non Solanaceae 8
Daucus Non Solanaceae 1
Dendrobium Non Solanaceae 1
Dichanthelium Non Solanaceae 4
Dorcoceras Non Solanaceae 1
Eragrostis Non Solanaceae 3
Erythranthe Non Solanaceae 1
Eucalyptus Non Solanaceae 1
Fagus Non Solanaceae 1
Genlisea Non Solanaceae 2
Handroanthus Non Solanaceae 3
Hordeum Non Solanaceae 1
Jatropha Non Solanaceae 1
Juglans Non Solanaceae 1
Leersia Non Solanaceae 2
Lupinus Non Solanaceae 1
Manihot Non Solanaceae 2
Medicago Non Solanaceae 2
Morus Non Solanaceae 1
Mucuna Non Solanaceae 1
Musa Non Solanaceae 1
Noccaea Non Solanaceae 4
Olea Non Solanaceae 1
Oryza Non Solanaceae 11
Panicum Non Solanaceae 8
Parasponia Non Solanaceae 1
Populus Non Solanaceae 2
Prunus Non Solanaceae 7
Punica Non Solanaceae 1
Ricinus Non Solanaceae 1
Rosa Non Solanaceae 5
Saccharum Non Solanaceae 2
Salvia Non Solanaceae 1
Selaginella Non Solanaceae 7
Setaria Non Solanaceae 3
Sorghum Non Solanaceae 3
Spinacia Non Solanaceae 1
Trema Non Solanaceae 1
Triticum Non Solanaceae 5
Vitis Non Solanaceae 3
Zea Non Solanaceae 2
Atropa Solanaceae 1
Capsicum Solanaceae 123
Nicotiana Solanaceae 65
Solanum Solanaceae 88
It shows how many PIs have a particular number of Cysteine in their sequences. The information can be retrieved from the sequence amino composition table.
Cysteine Count Number Of PIs
3 1
4 1
6 1
7 4
8 79
9 81
10 19
11 9
12 3
13 3
14 10
15 5
16 36
17 18
18 1
19 1
21 1
22 4
23 1
24 37
25 45
26 3
32 5
33 10
34 1
38 2
40 6
42 1
45 1
48 16
50 2
56 4
63 2
64 1
88 1
To show the distribution of Amino Acids in the composition of PIs sequences. We find the average of percentage of Amino Acid in each sequence.
Amino Acid Average Percentage
A 7.3
C 11.1
D 4.3
E 5.4
F 2.9
G 8.3
H 1.2
I 5
K 6.1
L 7.6
M 2.2
N 5.9
P 5.7
Q 1.8
R 3.7
S 6.9
T 5.5
U 0
V 4.6
W 0.2
X 0
Y 4.3
Z 0